新疆医科大学第五附属医院（原乌鲁木齐铁路中心医院）成立于1937年，至今具有70年的辉煌历史。其前身为“镇江铁路医院”，1958年以“兰州基地医院”进疆后，更名为乌鲁木齐铁路局中心医院。2004年6月，随着铁路主辅分离改革，医院整建制移交新疆医科大学，成为新疆医科大学第五附属医院暨第五临床医学院。
新疆医科大学第五附属医院地址为河南西路118号，地处铁路局商业圈中心，东邻北京路，北靠河南路，周边有瑞豪大酒店、红楼大酒店、西单商场、五一商场等大型酒店及商场。
新疆医科大学第五附属医院总占地面积52880平方米，建筑面积79744平方米；目前编制床位549张，开放床位787张；设有临床、医技等专业科室46个，行政职能部门16个；目前年门诊量三十万人次，年出院病人一万余人次。
新疆医科大学第五附属医院在职职工950人，专业技术人员743人，行政人员117，工勤人员91人，其中高级技术人员114人，有4人享受国务院政府特殊津贴，还拥有铁道部命名的“有特殊贡献专家”、“ 优秀科技工作者”等一批拔尖人才。
新疆医科大学第五附属医院长期以来，遵循“突出特色，重视人才，崇尚人文，遵循科学”的办院方针，逐渐形成了一批有实力的临床三级学科，有些学科进入区内同行先进序列。其中心血管内科、骨科、放射科曾是铁道部重点专科，在自治区同行中享有盛誉。近年来，医院努力打造科室特色，专科优势逐渐凸显，一批有实力的科室如：心血管内科、泌尿外科、肿瘤外科、骨科、神经内科、内分泌科、职业病防治科、康复医学科逐渐脱颖而出。