巴楚县人民医院的前身是巴楚县卫生院，成立于1951年，经过五十余年的艰苦创业，现已成为全县医疗技术中心，是一所集医疗、预防、保健、康复、科研、培训、教学为一体的初具规模的综合性医院。
巴楚县人民医院位于县城东区，占地面积70000平方米，目前总建筑面积16500余平方米，业务用房面积6960平方米。院内房屋的水、电、暖齐备，运行良好。医院周边环境绿化良好，无工业企业。医院有前、后两个大门，四周交通便利，极大的方便了各乡镇、团场的患者来我院就诊。建设中的综合住院大楼共七层，建筑面积达八千多平方米，全部为无障碍病房，将极大地改善病患就医条件。
巴楚县人民医院于1996年9 月被定为二级甲等医院，1998年11月被命名为“全国爱婴医院”，2000年被授于自治区级文明单位。全院设有31个科室，现有正式职工192人，其中卫生技术人员171人。