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大数据让普里昂疾病的基因风险获得重新评估
时间:2016-01-21 13:07:30  作者:网站编辑  来源:生物谷
在对60多万人的基因数据进行反复处理之后,研究人员发现普里昂疾病(prion diseases)的基因突变基础有着很大的差异,这些突变决定了其引起疾病的可能性有多大——它们可以从高度致病性到相对良性不等。

  在对60多万人的基因数据进行反复处理之后,研究人员发现普里昂疾病(prion diseases)的基因突变基础有着很大的差异,这些突变决定了其引起疾病的可能性有多大——它们可以从高度致病性到相对良性不等。这些发现可帮助遗传咨询顾问更准确地预测病人和其家人的发病风险,并能指导对普里昂疾病的治疗策略。这项研究还说明了病人的能动性(研究者之一也是一名患者)和数据共享(如来自像23andMe Inc.等基因测试公司的数据共享)可汇聚在一起来推进精准医学。普里昂疾病是一组罕见且致命的神经退行性病变,它们是由普里昂蛋白(PRNP)基因改变所导致的普里昂蛋白异常折叠引起的。折叠错误的普里昂蛋白会触发正常蛋白也出现折叠错误,从而形成对大脑造成损害的毒性团块。PRNP的63种基因变异株被怀疑会引起普里昂疾病。然而,某些具有该基因突变的人却从来不会发病,这让甄别良性与有害变异株的工作变得复杂。对罕见疾病而言,预测变异的外显率(即某个携带某种致病基因突变株者的实际会发病机率)会构成更大的挑战,因为罕见疾病能给研究提供的数据十分稀少。


  利用最近才获得的大规模基因组数据,Eric Vallabh Minikel和同事对1万6025名普里昂疾病患者的PRNP基因变异株和一个大型对照组人群进行了比较。后者是由来自外显子组整合数据联盟的6万又706位健康个人和23andMe Inc.的53万1575名客户组成的;这些人选择为研究而分享他们的数据。科学家们证实,先前已知的仅在患者中才被检测到的罕见变异株很明显会导致疾病。然而,某些被认为会引起普里昂疾病的变异株常常会在健康人中被发现——因此它们可能是良性的,而其它的一些变异株最后被证明只有低度的致病风险——因此应对其进行相应的重新分类。研究人员还发现了3名老年人,他们只携带一个PRNP基因的功能性拷贝,但他们却完全健康。这一发现或意味着目前正在研究的阻断PRNP表达的治疗策略可能比先前所认为的要更为安全。由Matthew Lebo、Sheila Sutti和Robert C. Green撰写的一篇《焦点》文章对研究成果进行了进一步的阐释。

关键字:普里昂疾病、基因风险
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