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北京大学开发创新性三重组学测序技术
时间:2016-02-25 10:57:18  作者:网站编辑  来源:生物通
来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称,他们开发出了一种创新性的单细胞三重组学测序(triple omics sequencing)技术:scTrio-seq,并利用它揭示出了肝细胞癌中的遗传、表观遗传及转录组异质性。

  来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称,他们开发出了一种创新性的单细胞三重组学测序(triple omics sequencing)技术:scTrio-seq,并利用它揭示出了肝细胞癌中的遗传、表观遗传及转录组异质性。这一重要的研究发布在2月23日的《Cell Research》杂志上。

  北京大学生命科学学院的汤富酬( Fuchou Tang)研究员、黄岩谊(Yanyi Huang)研究员以及首都医科大学彭吉润(Jirun Peng)教授是这篇论文的共同通讯作者。

  近年来开发出的单细胞基因组、DNA甲基化组和转录组测序技术大大地帮助解析了细胞群中的异质性。来自国内外的研究组报道称开发出了一些单细胞的RNA测序方法,诸如scRNA-seq, Smart-seq/Smart-seq2, CEL-seq, MARS-seq, STRT-seq, and Quartz-seq(Nature子刊:癌症单细胞测序新技术 ),并应用这些技术分析了哺乳动物胚胎发育过程中的基因表达动态或肿瘤抑制性。

  一些单细胞基因组测序技术也被用于揭示人类单个生殖细胞中的重组模式和非整倍性,以及肿瘤和循环肿瘤细胞中的基因组异质性(《细胞》:世界首个女性个人遗传图谱绘制完成 )。近期研究人员还开发出了一些单细胞DNA甲基化组测序技术,如ScRRBS和scBS-Seq,对单个细胞中的所有DNA甲基化进行分析。基于微阵列或新一代测序结合分析单细胞的基因组和转录组也被成功用于解析肿瘤异质性(Nature Methods发布重磅测序技术:基因组和转录组平行测序 )。

  然而,要直接分析单个细胞中遗传和表观遗传因子调控基因表达的机制,需要开发出能够在单细胞中同时分析基因组、表观基因组合转录组的方法。这种方法尤其适宜于三个组学显示强异质性的癌症。

关键字:三重组、测序技术
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