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再生生物学多组学数据库发布
时间:2021-10-13 09:06:02  作者:Annie  来源:北京基因组研究所
Regeneration Roadmap数据库实现了对多物种再生相关的不同层次组学数据的收录与整合。


          随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再生相关的基础研究和临床转化应用的不断发展。
          再生医学网获悉,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)鲍一明研究组、张维绮研究组和中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组合作,在NucleicAcidsResearch杂志发表论文,建立了再生生物学领域首个多组学数据库RegenerationRoadmap。该数据库从转录组、单细胞转录组、表观基因组及药物基因组等不同层面整合了再生相关数据集,涉及11个物种、36种组织类型,实现了不同条件下基因表达随再生变化的汇聚融合,以及对不同层次组学数据的交互查询和联合比较分析。此外,数据库收录了基于已有文献报道的再生相关基因集,使得用户可以更加深入全面地了解特定基因或通路在再生生物学中的功能。
          RegenerationRoadmap数据库实现了对多物种再生相关的不同层次组学数据的收录与整合。作为一个持续更新的国际化信息平台,RegenerationRoadmap的建立为国内外再生生物学相关数据的统一汇交、集中存储、安全管理、开放共享以及前沿交叉研究和临床转化应用提供了助力和支撑。该数据库对用户免费开放,相关运维团队将对该数据库进行定期维护与更新,不断整合更多的再生相关数据资源、汇交多层次组学数据。此外,该团队于2020年建立了AgingAtlas(AA)数据库,收录和整合了与衰老相关的不同层次多组学数据。目前AgingAtlas数据库已服务来自全球25个国家的上万名访问者。AgingAtlas和RegenerationRoadmap数据库将形成资源互补,共同推动衰老生物学和再生生物学的学科发展。
          再生医学网将持续跟进相关研究进展。
          (备注:部分图片及文字源自网络。)
关键字:再生生物学
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