目前，常应用的间充质干细胞为骨髓间充质干细胞、脐带血间充质干细胞和皮肤间充质干细胞，它们都具有增殖分化潜能高、免疫原性低等特点，但脐带血间充质干细胞仅在分娩新生儿时进行采集，因此来源受限。而骨髓间充质干细胞的制备过程不容易质控;移植给异体可能引起免疫反应;取材时对患者有损伤，患者有骨髓疾病时不能采集，即使是健康供者，亦不能抽取太多的骨髓，这都限制了骨髓间充质干细胞临床应用。

    与此两类干细胞相比，皮肤间充质干细胞取材方便，并且分离细胞的数量和纯度均很高，多次传代扩增后仍具有干细胞特性，并且不论是自体还是同种异源的间充质干细胞，一般都不会引起宿主的免疫反应。