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一个快速廉价鉴别古人类中细菌DNA的新方法
时间:2014-03-13 10:13:15  作者:网站编辑  来源:医学论坛网
研究传染病起源和人口健康问题所面临的挑战之一是,古人类遗留物一般含有高度降解的DNA,在其中能够感染的部分经常只是少数。

    研究传染病起源和人口健康问题所面临的挑战之一是,古人类遗留物一般含有高度降解的DNA,在其中能够感染的部分经常只是少数。这会使得基于序列的元基因组分析成本高昂、耗费时间。
现在,研究人员找到对古人类样本进行筛查来寻找传染病的一个新方法。这项原理证明研究利用一个微生物检测阵列在两个古人类样本中正确识别出了以前被确认的细菌病原体的DNA。
    Hendrik Poinar及同事提出,微阵列(它们的多功能性对现代临床样本已得到充分证明)也许能够为复杂样本中的微生物多样性提供一个快速的、但又全面的快照,而不需要进行冗长的分析,也不会产生高吞吐量筛选所涉及的高成本。
    本文作者利用“劳伦斯·利弗莫尔微生物检测阵列”(LLMDA)成功识别出了以前确认的人类细菌病原体,其中包括在来自公元1849年的一个小肠样本中识别出了霍乱弧菌(造成霍乱)和在来自公元1348年的一颗牙齿中识别出了鼠疫耶尔森氏菌(造成“黑死病”瘟疫)。
    这些发现表明,LLMDA能在古样本中识别出原始的和/或共感染的细菌病原体。该研究显示了微阵列成为考古样本的一个有用筛选工具的潜力,利用它们可以对微生物特征进行快速、廉价和准确的重建。

关键字:细菌DNA
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