6种疾病分别是自身免疫性甲状腺病、乳糜泻、克罗恩病、银屑病、多发性硬化症和1型糖尿病，目前对于这些疾病的确切病因并不清楚，人们认为是遗传和环境因素的复杂组合作用所导致。已经鉴别的遗传变异只能解释每种疾病部分的异质性。到目前为止，所采用的技术通常鉴别出的都是只具微弱效应的群体常见变异。

    在这项研究中，来自全球的科学家组成的一个研究小组利用高通量测序技术，力图在一个包括近42,000名个体（24,892名自身免疫性疾病患者和17,019名对照）的样本中，鉴别出从前确认的25个风险基因的新变异，其中包括罕见变异和潜在高风险变异。

    在一项“罕见变异综合性全基因组关联假说”中，人们提出风险基因中少量的罕见变异有可能是这些疾病异质性的主要原因。

    然而，Nature新研究表明，这些疾病的遗传风险更有可能，与在群体中数百个常见的微弱效应变异的复杂组合有关。

    作者估计，对于可通过常见变异进行解释的疾病，这些风险基因中的罕见变异只大约导致了3%的异质性。该研究的领导者、伦敦大学玛丽女王学院胃肠道遗传学教授David van Heel说：“研究结果表明，这些自身免疫性疾病的风险并不归因于少数的高风险遗传变异，而是具有微弱效应的许多常见遗传变异随机选择所导致。”

    “在每一种疾病中都有可能存在成百上千这样的变异，遗传风险有可能来自于遗传自父母双亲的大量的这些变异。如果情况确是这样的话，我们或许永远也不可能准确预测个体罹患这些常见自身免疫性疾病的遗传风险。不过新研究结果为我们提供了有关这些疾病的生物学基础和相关信号通路的重要信息，有可能促使发现新的药物靶点。

    该研究利用高通量测序技术，第一次证明了测序可以与基因分型芯片平台一样准确，可作为“金标准技术”用于基因分型。论文的共同作者、Barts与伦敦医学和牙医学院副校长Richard Trembath说：“研究结果提示需对决定常见自身免疫性疾病形成风险的遗传结构进行重新评估，并将推动未来仔细评估除已知赋予了这些重要医学疾病敏感性的区域之外的人类基因组区域。”

    研究人员还发现，同一人身体左右两侧的真菌群落结构非常相似。而且皮肤上的真菌群落相当稳定，在相隔三个月的两次检测中差异不大。